“脑功能和脑重大疾病的基础研究”项目执行期间，取得了众多突出成果。
在离子通道研究方面，新型通道型高效人造抗菌工程多肽的构建，为制备人造多结构域蛋白质分子机器和新型分子药物开辟了新方向和新技术途径；为国产资源独特的离子通道型活性物质的开发利用奠定了坚实的理论基础和技术平台。
在突触传递研究方面，对痛觉机制的研究可能为疼痛的治疗提供重要启示；对视网膜谷氨酸受体失敏的研究有可能为某些视网膜疾患的起因提供解释。
在神经元受体及信号转导研究方面，对阿片受体信号转导的研究揭示了蛋白激酶在药物成瘾过程的重要作用和机制，为开发戒毒药提出了新思路。
在神经元信息编码与加工研究方面，将针刺镇痛理论拓展至临床治疗毒品成瘾；具有自主知识产权的蜜蜂毒实验痛模型可用于大规模镇痛新药的筛选。
在神经元生长、发育及其调控研究方面，GDNF对神经轴突再生的促进和运动功能的恢复，提示GDNF可能应用于外周神经损伤及神经病变的治疗。
在脑高级功能的机制研究方面，前额叶-2受体功能的研究为寻找多动症的新治疗途径和新药物开发提供了扎实的理论基础；应激对海马功能的影响研究为治疗毒品成瘾提供了新途径和新药靶。
在老年痴呆症（AD）的发病机制和防治基础研究方面，阐明脑内褪黑素（MT）下降与脑老化的关系，为发展MT检测作为AD症患者早期诊断的可能性提供重要依据，并从机制上提出MT的脑保护作用及预防脑老化的潜在可能性。
在帕金森病（PD）发病机制和防治基础研究方面，提出了GDNF和TH双基因治疗策略；在模型大鼠上确认电针改善PD症状，为PD的电针防治奠定了科学基础；中药雷公藤单体T4和T10有可能进一步开发为防治PD的新药。
