荧光抗体在使用前应加以鉴定。鉴定指标记包括效价及荧光素与蛋白质的结合比率。抗体效价可以用琼脂双扩散法进行滴定，效价大于1：16者较为理想。荧光素与蛋白质结合比率（F/P）的测定和计算的基本方法是：将制备的荧光抗体稀释至A2801≈1.0，分别测读A280 （蛋白质特异吸收峰）和标记荧光素的特异吸收峰，按公式计算。
F/P值越高，说明抗体分子上结合的荧光素越多，反之则越少。一般用于固定标本的荧光抗体以F/P=1.5为宜，用于活细胞染色的以F/P=2.4为宜。
抗体工作浓度的确定方法类似ELISA间接法中酶标抗体的滴定。将荧光抗体自1：4～1：256倍比稀释，对切片标本作荧光抗体染色。以能清晰显示特异荧光、且非特异染色弱的最高稀释度为荧光抗体工作浓度。
荧光抗体的保存应注意防止抗体失活和防止荧光猝灭。最好小量分装，-20℃冻存，这样就可放置3～4年。在4℃中一般也可存放1～2年。
