我国已明确建立甲型H1N1流感疫苗接种的叫停机制。发现疑似预防接种异常反应发生率高于预期或呈明显聚集性分布，出现格林巴利综合征及其他严重神经系统疾患，发生死亡、残疾等严重事件，发生群体性反应或对社会有重大影响的事件时，县级疾病预防控制机构应向同级卫生行政部门报告；县级卫生行政部门应立即通报县级食品药品监督机构，并作出暂停相关疫苗接种的决定，同时向上级卫生行政部门报告。这是卫生部9月23日发布的《2009年秋冬季甲型H1N1流感疫苗预防接种指导意见》透露的信息。
卫生部规定，在接到报告后，地市级卫生行政部门应立即组织由流行病学、免疫规划、药品不良反应监测、临床等领域专家组成的专家组，对县级卫生行政部门上报的疑似预防接种异常反应相关资料进行调查论证。对于不能排除疫苗质量问题，或异常反应发生率明显高于预期，或无法得出结论的，应向省级卫生行政部门提出叫停接种的建议，并向同级食品药品监管部门通报。对于认定为预防接种实施差错及偶合症或心因性反应的，应及时撤销暂停，并妥善处理。省级卫生行政部门应组织省级专家组对地市级卫生行政部门报送的材料进行调查论证，并作出叫停接种或撤销暂停接种的决定。处理结果应及时向卫生部报告，同时向国家食品药品监督管理局通报。卫生部视情况将有关疫苗接种叫停信息向全国通报，并组织专家对各地调查处理工作提供技术支持。
据悉，现在应用的“甲流”疫苗为裂解疫苗，其成分无感染性，不会引起“甲流”。我国和其他国家目前还没有接种“甲流”疫苗的严重不良反应和罕见不良反应的资料。专家推测，接种“甲流”疫苗的严重不良反应与接种季节性流感疫苗相近。
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