临床标本送往细菌实验室后，应立即接种到适当的分离培养基上。依据卫生部临床检验中心推荐，细菌实验室应备有如下分离培养基：
（一）血平板
适于各类细菌的生长，一般细菌检验标本的分离，都应接种此平板。
（二）巧克力血平板
其中含有V和X因子，适于接种疑有嗜血杆菌、奈瑟菌等的标本。
（三）中国蓝平板或伊红美蓝平板
可抑制革兰阳性细菌，有选择地促进革兰阴性细菌生长，是较好的弱选择性培养基。发酵型革兰阴性杆菌因分解乳糖能力不同，在此平板上菌落颜色不同，便于鉴别菌种。
（四）麦康凯平板
具中等强度选择性，抑菌力略强，有少数革兰阴性菌不生长。在麦康凯平板上能否生长，是非发酵菌鉴定的一个依据。
（五）SS琼脂
有较强的抑菌力，用于志贺菌和沙门菌的分离。因选择性过强，可影响检出率，所以，使用时最好加一种弱选择平板以配对互补。
（六）碱性琼脂或TCBS琼脂
用于从粪便中分离霍乱弧菌及其他弧菌。
（七）血液增菌培养基
用于从血液、骨髓中分离常见病原菌。
（八）营养肉汤
用于标本及各类细菌的增菌。
根据标本来源和可能存在的病原菌，确定选用各种分离培养基。如痰标本一般选用血平板、中国蓝/麦康凯、巧克力平板作分离。其中血平板用于肺炎链球菌、白喉棒状杆菌等的分离；中国蓝/麦康凯用于筛选革兰阴性杆菌；而含杆菌肽的巧克力平板用于筛选嗜血杆菌等，以期提高细菌检验的准确性。
