细菌合成代谢产物有热原质、毒素和侵袭性酶、色素、抗生素、细菌素以及维生素。
（1）热原质：大多数为革兰阴性菌合成的菌体脂多糖。注入人体或动物体内能引起发热反应，故称热原质。
注：热原质耐高温，121℃20min不被破坏，蒸馏法去除热原质较好。
（2）毒素和侵袭性酶：细菌产生毒素，包括内毒素和外毒素。
内毒素为革兰阴性菌的脂多糖。
外毒素是革兰阳性菌产生的蛋白质，毒性强且有高度的医学.教育.网收.集整理选择性。
侵袭性酶，如卵磷脂酶、透明质酸酶等。
（3）色素：有水溶性色素（铜绿假单胞菌的色素）和脂溶性色素（金黄色葡萄球菌的色素）。不同细菌产生不同的色素，在鉴别细菌上有一定意义。
（4）抗生素：是由某些微生物代谢过程中产生的、能抑制或杀死另一些微生物和癌细胞的微量生物活性医学.教育.网收.集整理物质。
注：抗生素大多数有放线菌和真菌产生，细菌只可以产生少数几种，如多粘菌素和杆菌肽等。
（5）细菌素：某些细菌菌株产生的一类具有抗菌作用的蛋白质，细菌素作用范围狭窄，仅对与产生该种细菌素的细菌有近缘关系的细菌才能起作用，如大肠菌素、绿脓菌素、变形菌素和弧菌素等。
（6）维生素。
