基础免疫学（basicimmunology）是研究免疫系统组织结构、生理功能及其调节的几个学科分支的统称。包括以下几个方面。
1.免疫生物学（immunobiology）是研究免疫系统组成、免疫应答发生的机制、类型及其调节的学科。目前已经大体清楚民淋巴样细胞各类群和单核巨噬细胞的发育过程、主要特征、免疫功能与检测方法，以及它们在免疫应答中识别与递呈抗原、相互识别与协作的基本过程及机制。免疫生物学的成果可望能够对免疫应答进行特异性的人工调节，克服超敏应答对机体的损害，抑制器官移植的排斥反应，使自身免疫病患者重近对自身抗原的免疫耐受状态。
2.分子免疫学（molecularimmunology）是研究免疫分子及其受体的化学结构、基因表达、生物活性及其检测的学科，免疫化学（immunochemistry）的大部分内容可以包涵在这个学科中。免疫蛋白基因的研究、独特型抗体的发现、杂交瘤单克隆抗体技术的创立、基因工和抗体的制备、免疫细胞因子的进展等使得分子免疫学成为整个免疫不中最活跃的一个分支。从微观入手研究整体效应可望取得意想不到的效果，不久将会有更多的免疫分子应用到临床诊断和治疗以及疾病预防中。
3.免疫遗传学（immunoginetics）是从遗传学角度研究免疫应答发生及其调控的学科。人类的医学教`育网搜集整理免疫应答主要受控于人类白细胞抗原（HLA）基因组棗人的主要组织相容性复合体（MHC），机体对某抗原是否产生应答、应答过程中免疫细胞间的相互识别与合作、Tc细胞的杀伤活性等都受MHC的限制。器官移植排斥反应和某些变态反应都与MHC有关；MHC还与多种疾病、与母胎关系和衰老等多种临床和生物学现象关联。免疫遗传学的研究正日益受到重视，许多免疫学上的难题可望从遗传学方面找到答案。
4.免疫病理学（immunopathology）是研究免疫相关疾病的发生、发展和转归及其机制的学科，是基础免疫研究通向临床医学的桥梁。目前对免疫炎症的发生机制已经基本了解，过去许多原因不明、机制不清的疾病都已证明是自身免疫病或免疫相关性疾病。这些成果为有关疾病的诊断和治疗提供了理论基础。另外，免疫系统本身的异常，例如免疫缺陷病（包括艾滋病）和免疫增殖病等，也都等到了较为深入的研究。
