自身抗体检测的临床应用如下：
一、一般原则
某些自身抗体敏感性高，特异性不强，具有筛选意义而不具有诊断价值。另一些则敏感性低，但对某种AID诊断的特异性较高，相关性强。可以先以ANA作筛查，然后再作其他检测。
二、方法的选择与结果的确认
首选间接免疫荧光法，因为IIF是以细胞组织成分作抗原基质，免疫荧光定位分析最为客观，为检测自身抗体的经典试验。对单一抗原成分检测，常用ELISA和Western-Blot法。因包被时需用纯化抗原，才能保证结果的准确与特异性，因此，限制了其应用。
三、自身抗体检测的质量控制
一般应在每次实验时，同时设立阴性阳性对照，以监测结果的准确性。应该参加室间质控；选择符合标准的试剂盒；建立规范化的实验流程等。
