由于抗核抗体（ANA）的复杂性及多样性，故测定方法繁多。目前ANA常用的方法有免疫荧光法、放射免疫法、ELISA、免疫双扩散、对流免疫电泳及免疫印迹技术等。
常用间接免疫荧光法（indirect immunofluorescence，IIF）作为总的ANA筛选试验。鼠肝常用于检测抗核抗体，但近十年来多被HEp-2细胞所代替，这是因为HEp-2细胞具有以下特点：人源性；细胞核大；分裂期细胞多；可大批量培养。当然，单个细胞不可能替代组织切片，所以鼠组织切片仍继续用于自身抗体的检测。
放射免疫法：常用于检测抗DNA抗体，有Farr法及过滤法。
（1）Farr法的原理为用同位素标记DNA，被标记的DNA和被检血清的抗DNA抗体结合，经50%硫酸铵饱和液沉淀，然后比较沉淀物和上清液中的放射活性，从而得出DNA结合活性，一般结合率大于20%为阳性。
（2）过滤法是在分离结合物时用纤维素酯薄膜滤器（孔径为0.45μm）进行过滤，游离的DNA被滤去而与抗体结合的复合物被阻留在滤膜上。
ELISA法：临床上主要是应用间接ELISA检测抗dsDNA抗体，其重复性及敏感性均较对流免疫电泳及双扩散为高。目前已有试剂盒供应。
免疫印迹（immunoblotting）法：先将混合抗原作凝胶电泳，分离开不同的区带，然后将这些带转印到硝酸纤维素膜上，最后用酶标抗体或放射性同位素标记抗体进行检测和分析。由于该试验不需纯化的单个抗原，可在同一固相上作多项分析检测，灵敏度高，特异性强。故目前已广泛用于自身免疫病患者血清中多种自身抗体的检测，如检测抗Sm抗体、抗RNP抗体、抗SS-A抗体及SS-B抗体等。
另外，还可用传统的琼脂双向扩散法、医学|教育网搜集整理对流免疫电泳法、间接血凝法和补体结合试验等。这些试验要求的实验条件比较低，但敏感性也比较低。
