尿液干化学分析仪与传统显微镜检查是两种原理不同的检验技术，在临床上中可能出现化学法分析结果与镜检结果不相符的情形。如：
（1）白细胞：①分析仪法（+），镜检法（-）：可能的解释为尿液在膀胱贮存时间过长或其他原因致使白细胞破坏，中性粒细胞酯酶释放到尿中所致。②分析仪法（-），镜检法（+）：这种情形多发生在肾移植患者发生排异反应时，尿中以淋巴细胞为主，另外尿液中以单核细胞为主时也会出现此结果，因干化学法检测的是尿中完整的及溶解的中性粒细胞，而与淋巴细胞及单核细胞不起反应，此时，应以显微镜检查为准。
（2）红细胞：①分析仪法（+），镜检法（-）：这种情形可由于尿液中红细胞常被破坏而释放出血红蛋白，多发生于肾病患者，或某些患者尿液中含有对热医学教 育网 原创不稳定酶、肌红蛋白或菌尿，引起红细胞干化学法测定结果的假阳性；将尿液煮沸冷却后再测试可以排除对热不稳定酶的影响。②分析仪法（-），镜检法（+）：这种情形一般很少，但可发生在尿液中含有大量VitC（>100 mg/L）或试带失效时；若使用尿十一联试带，可通过观察VitC的含量来加以判别。对于上述医学教育网整理干化学法与显微镜镜检所出现的矛盾，要结合临床综合分析，动态观察，合理解析实验结果。
中华医学会经过多次专家研讨会，制定了尿液干化学分析仪筛检标准。即：当干化学尿试带质量合格、尿液分析仪运转正常情况下，试验结果中白细胞、红细胞、蛋白及亚硝酸盐全部为阴性时，可以免去对红细胞和白细胞的显微镜检查，但如果其中有一项阳性结果，必须同时进行显微镜检查。这个筛选条件的基本原则是能筛检出健康人医学教育网整理标本，但不遗漏异常标本，避免出现假阴性。对出现假阳性的标本，则可以通过镜检进一步排除，以达到不误诊的目的。
但是这种筛检具有局限性：①肾科患者尿液不适合干化学检查，而应作湿化学及显微镜检查。②以镜检有形物质（如结石、结晶等）结果作为要诊断依据和观察医学教 育网 原创疗效指标时，上述原则适用。总之，虽然干化学尿液分析取得了重大进展，但迄今为止，没有一台仪器的检测结果能完全替代显微镜，尿沉渣镜检以其独特临床价值仍是尿液医学教育网整理分析中不可缺少的检查手段。
